本发明通过组学测序筛选出1个大肠杆菌F18感染调控的关键候选lncRNA‑FUT3‑AS1，序列为SEQ ID NO:1，在此基础上，本研究围绕FUT3‑AS1功能与调控机制开展深入分析，首先利用qPCR和Northern blot技术检测了FUT3‑AS1在梅山猪与苏太猪F18大肠杆菌敏感型与抗性型断奶仔猪十二指肠中的表达差异情况，成功建立lncRNA‑FUT3‑AS1沉默的猪小肠上皮细胞，干扰效率达到68%，且通过细菌计数、革兰氏染色、扫描电镜以及间接免疫荧光等一系列检测手段发现，沉默lncRNA‑FUT3‑AS1可以显著地降低F18大肠杆菌对IPEC‑J2由此表明，lncRNA‑FUT3‑AS1在断奶仔猪抵抗F18大肠杆菌侵染过程中发挥了重要的抗性调控功能，其表达水平下调降低了小肠上皮细胞对F18大肠杆菌的黏附能力，有助于提高仔猪对F18大肠杆菌侵染的抵抗能力
本发明涉及一株同时表达F4和F18菌毛的猪源大肠杆菌无毒分离株及其应用，所述猪源大肠杆菌无毒分离株F418的保藏编号为CCTCC M 2022089，保藏日期为2022年1月18日。本发明分离菌株为大肠杆菌，能同时表达F4和F18两种菌毛抗原，为猪源自然分离株，PCR测试表明该菌株缺乏LT和STb肠毒素基因，不产生肠毒素，能够良好地黏附定植于宿主猪，该菌株具有开发成细菌无毒活疫苗候选株的潜力，通过口服该毒株能够良好地黏附定植于宿主猪，诱导仔猪产生抗F4和F18两种菌毛抗原的免疫应答，发挥一定免疫效力，安全性具有保障，有望成为防控F4和F18大肠杆菌感染的潜在活疫苗候选株。
